Pôle Algues

Algues

Les membres de l’équipe du pôle algues interviennent aux Antilles depuis 2005 et en Guyane depuis 2008 et ont ainsi apporté leur savoir-faire sur de nombreux dossiers comme la création d’indices diatomiques adaptés à ces zones géographiques (Indice Diatomique Antillais – IDA et Indice Diatomique de Guyane Française – IDGF) et à leur mise en œuvre dans les suivis DCE.

Une coopération étroite entre INRAE, l’OFB et HYDRECO avec la participation de taxonomistes académiques va permettre d’avancer sur ces flores diatomiques encore méconnues et ainsi faire progresser les connaissances en taxinomie, en biodiversité et ainsi participer à l’amélioration des outils de bioindication par les diatomées dans la zone Antilles/Guyane.

Ils participent également aux suivis DCE Eaux Littorales depuis 2013 en Guyane, 2016 en Guadeloupe et 2017 en Martinique. En métropole, une forte collaboration a été mise en place avec l’Ifremer dans le cadre des suivis REPHY Sanitaires (Ifremer de Sète) et de nombreuses analyses et suivis sont effectués pour divers clients sur la façade atlantique, en Manche et en Méditerranée.

Nos prestations

Les activités du pôle algues sont axées sur les milieux marins et dulçaquicoles, tropicaux et équatoriaux (Antilles, Guyane, Indonésie, Réunion, Tunisie), ainsi qu’hexagonaux (Manche, Bretagne, Golfe de Gascogne, Golfe du Lion, etc.).

Diatomées

Phytoplancton

Macrophytes

Notre équipe

Anne EULIN-GARRIGUE

Responsable du pôle

Docteur en Hydrobiologie spécialisée dans l'étude des diatomées

Bioindication & Biomonitoring, Taxinomie, Biodiversité, R&D

Julian FREDERICK

Ingénieur hydrobiologiste

Gestion des activités de terrain et de laboratoire, Formation, SMQ, gestion d’étude

Sylvain COULON

Ingénieur hydrobiologiste spécialisé dans l’étude du phytoplancton marin

Bioindication & Biomonitoring, Taxinomie, Biodiversité

Lenaig KERMARREC

Docteur en Biodiversité, Ecologie, Environnement spécialisée dans l’étude des diatomées, du Barcoding et de l’ADNe

Bioindication & Biomonitoring, Taxinomie, Biodiversité, ADNe & Barcoding, R&D

Nos moyens

Diatomées

Tous les échantillons de diatomées sont traités, stockés et archivés dans notre laboratoire en Guyane et nous disposons de tout l’équipement nécessaire pour la fabrication des lames dans des conditions optimales.

Microscope OLYMPUS BX53, écran 4K et caméra numérique

Les diatomistes travaillent sur deux microscopes Olympus BX53 équipés du contraste interférentiel et du contraste de phase, géré par le logiciel CellSens et pouvus d’une caméra haute définition pour l’acquisition d’image et la mesure des diatomées.

Quelques diatomées de Guyane (observation directe sur écran lors du comptage) :

Notre fond bibliographique est en perpétuel évolution pour suivre au plus près les avancées de la taxinomie des diatomées, qu’elle soit basée sur la morphologie, ou sur les techniques ADN et phylogénétiques.

Phytoplancton

Les échantillons sont stockés et traités dans nos bureaux à Toulouges (Pyrénées-Orientales).

Le laboratoire permet ensuite la préparation des échantillons (cuves à sédimentation Hydrobios) pour observation aux microscopes inversés (LEICA DMi1 et LEICA DMiL LED, objectifs x20 et x40, appareillage de fluorescence).

Du matériel de prise de vue offre la possibilité d’effectuer des images des observations microscopiques et donc d’illustrer résultats, rapports et publications

Nos collaborateurs sont membres de l’Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), de l’International Society of Diatom Research (ISDR) et de l’Association Française de Limnologie (AFL) et participent régulièrement aux Workshops dédiés à la taxinomie et au métabarcoding des diatomées et du phytoplancton.

Le spécialiste en phytoplancton marin est en relation avec les spécialistes de l’Ifremer pour l’aide et la confirmation des déterminations si besoin par le biais d’échanges de photographies. Il participe régulièrement aux journées REPHY et PHYTOBS organisées par l’Ifremer pour permettre des discussions et des échanges sur la détermination du phytoplancton (colloques, ateliers, intercalibration).